重新布局避难所的关键在于合理规划空间和资源分配。首先进入主控室点击重构按钮，在重构界面中选择需要移动或改建的房间，调整位置后保存即可。注意电梯和其他房间必须保持连通，否则会保存失败。重构过程中可以利用制造功能将杂物转化为资源，同时优化居民组合提升新生儿属性。日常管理别忘了关注居民健康和训练，受伤居民在房间内能恢复血量，仓库和训练室工作不要求特定属性，所有居民都能胜任。
前期布局不用过于复杂，优先保证基础资源供应。每层除第一层16格外其他都是18格，电梯占1格，房间占2格，3个相同房间可合并为大房间提升效率。电力需求最大，建议多建电厂并集中放置；净水厂和餐厅也需要至少一个三联大房间。住宅区要保证足够空间用于休息和生育，两个三联房间比较合适。电梯每层一个足够，避免浪费电力和瓶盖。资源紧张时先维持生存，后期再大拆大建。
一层大门右侧建议放三联大房间作为防御核心，配备高属性和强力武器的居民。相同工作场所尽量相邻便于管理，电力层放在上层，水电食物按需分配。无人房间尽量菱形隔开防止灾害扩散，底层仓库菱形分布能有效阻挡辐射蝎。训练室靠近工作区方便调配人员，核电站和可乐工厂后期优先升级。记得储备满属性1级小人用于任务和替换。
火灾、虫灾会随房间等级提高而增强，需确保每个区域有快速救援能力。死爪入侵强度与居民平均等级相关，建议将高等级居民和武器集中在一层。巧手先生别参与战斗，调到安全楼层自动收集资源。治疗针和消辐宁要预留充足库存，医院和科学站无需过早建造但40人口后必须配备。遇到灾害时优先保护生产房间，闲置人员可派往废土探险。
